Fakultas Kedokteran Hewan merupakan salah satu fakultas di lingkungan Universitas Syiah Kuala. Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Syiah Kuala (FKH USK) selaku Unit Penyelenggara Program Studi (UPPS) pada awalnya didirikan sebagai Fakultas Kedokteran Hewan dan Peternakan (FKHP) bagian dari Universitas Sumatera Utara, Medan berdasarkan Keputusan Menteri P.P dan K. Nomor 79966/UU Tanggal 17 September 1960. Pendirian fakultas ini merupakan prioritas dari hasil analisis dan pemikiran tokoh Aceh saat itu berdasarkan potensi agraris dan peternakan Daerah Aceh. Dengan diwujudkannya pendirian USK melalui Keputusan Menteri PTIP Nomor 11/1961 tanggal 21 Juni 1961, maka FKHP USU Medan diintegrasikan ke USK pada upacara serah terima tanggal 30 November 1961. Sejak tahun 1985, yaitu setelah diterbitkannya Surat Keputusan Menteri P dan K Nomor 1312 tanggal 10 Oktober 1985 tentang integrasi Jurusan Peternakan ke dalam Fakultas Pertanian, FKHP berubah menjadi Fakultas Kedokteran Hewan (FKH). Fakultas Kedokteran Hewan terdiri dari beberapa Program Studi yaitu Program Studi Pendidikan Dokter Hewan (PS-PDH), Program Studi Pendidikan Profesi Dokter Hewan (PS-PPDH), Program Studi S2 Kesehatan Masyarakat Veteriner (PS-S2 Kesmavet) dan Program Studi D3 Kesehatan Hewan (PS-D3 Keswan).

Dalam perkembangan selanjutnya berdasarkan Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional Nomor 145/DIKTI/Kep/2007 tanggal 21 September 2007 tentang penetapan dan penataan kembali izin penyelenggaraan PS USK di Banda Aceh, sehingga menjadi dua Program Studi (PS) terpisah yaitu PS-PDH (kode: 10103) dan PS-PPDH (kode: 10103).

Kemudian penyelenggaraan PS PDH dan PS PPDH pada tahun 2016, berlanjut dengan diperolehnya akreditasi A berdasarkan Surat Keputusan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional Republik Indonesia (RI) Nomor 1447/SK/BAN-PT/Ak-SURV/ PSPKH/VIII/2016, tertanggal 4 Agustus 2016 yang berlaku sampai dengan 26 Februari 2021.

Saat ini dalam mendukung penyelenggaraan pembelajaran UPPS memiliki sejumlah sarana. Diantaranya adalah 12 laboratorium dan didukung dengan sarana lainnya, yaitu:  Rumah Sakit Hewan Pendidikan (RSHP) Prof. Dr. Noerjanto, M.Sc, Ruang Baca, Ruang Komputer, Ruang Bimbingan dan Konseling, Ruang Pengelola Jurnal, Unit Layanan Alumni Carier Center, Unit Pelaksana Teknis (UPT) Laboratorium Hewan Coba, Pusat Kajian Satwa Liar, Pusat Veteriner Tropis-OHCC dan Mushalla An-Nahl. Dengan tersedianya sarana prasarana tersebut telah dapat meningkatkan kualitas Pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat. Fakultas Kedokteran Hewan USK mengemban dan melaksanakan tridarma perguruan tinggi untuk menghasilkan lulusan berkualitas. Selain itu juga diarahkan mampu mengintegrasikan, menerapkan, dan mengembangkan Ilmu Veteriner secara kompeten agar mampu bersaing di tingkat Nasional dan Global.